项目成员

周丰丰,中国科学院深圳先进技术研究院,健康信息学研究员,博士生导师。深圳市海外高层次人才孔雀计划B类,IEEE(美国电气和电子工程师协会)高级会员,中国科学院"百人计划"。师从中国科学技术大学计算机系的陈国良院士,2005年7月获得计算机软件与理论专业博士学位。于2005年9月在美国乔治亚大学摄政教授徐鹰教授的实验室担任健康信息学博士后,从事比较生物组学与电子病历信息融合分析方面的研究,并于2009年1月晋升为助理研究科学家。2011年结束美国佐治亚大学的研究工作,并被中国科学院深圳先进技术研究院聘用为健康信息学研究员。已发表学术论文31篇,其中包括SCI索引28篇,主要作者论文(通信或者第一作者)21篇。影响因子合计为104.044分,以及总引用次数865次。学术成果多次在包括Nature Protocols(IF: 9.924,JCR二区,1篇)、Nucleic Acids Research(IF: 8.026,JCR二区,3篇)、Bioinformatics(IF: 5.468,JCR二区,3篇)、BMC Genomics(IF: 4.073,JCR二区,2篇)、PLoS ONE(IF: 4.092,JCR二区,2篇)和Genetics(IF: 4.007,JCR二区,1篇)等高水平SCI索引学术期刊上发表。相关成果曾获国际疾病预测竞赛2012年度第三名(共55个学术团队参加)和2013年度第四名(共28个团队参加)。应邀担任新杂志Frontiers in Bioinformatics and Computational Biology的副主编、BioEnergy Research(SCI索引,影响因子3.562)的唯一生物信息学编委以及PLoS ONE(SCI索引,影响因子4.351)编委,并多次应邀评审国际项目标书、国际学术期刊和会议的投稿论文。

代表性论文列表:(* 表示第一作者,# 表示通信作者。健康信息学领域通信作者亦为论文主要作者。)

[1] Guo P, Luo Y, Mai G, Zhang M, Wang G, Zhao M, Gao L, Li F, Zhou F#: Gene expression profile based classification models of psoriasis. Genomics 2014, 103(1):48-55.

[2] Yang M, Liu B, Zhao M, Li F, Wang G, Zhou F#: Normalizing electrocardiograms of both healthy persons and cardiovascular disease patients for biometric authentication. PloS one 2013, 8(8):e71523.

[3] Sablok G, Wu X, Kuo J, Nayak KC, Baev V, Varotto C, Zhou F: Combinational effect of mutational bias and translational selection for translation efficiency in tomato (Solanum lycopersicum) cv. Micro-Tom. Genomics 2013, 101(5):290-295.

[4] Ma Q, Luo Y, Guo P, Gao G, Yang M, Sablok G, Zhang Y, Zhou F#: Clinical effects of Xinmailong therapy in patients with chronic heart failure. International journal of medical sciences 2013, 10(5):624-633.

[5] Li K, Yang M, Sablok G, Fan J, Zhou F#: Screening features to improve the class prediction of acute myeloid leukemia and myelodysplastic syndrome. Gene 2013, 512(2):348-354.

[6] Zhou F*, Ma Q*, Li G, Xu Y: QServer: A Biclustering Server for Prediction and Assessment of Co-Expressed Gene Clusters. PloS one 2012, 7(3):e32660.

[7] Xu Y, Cheng W, Nie P, Zhou F#: WinHAP: An Efficient Haplotype Phasing Algorithm Based on Scalable Sliding Windows. PloS one 2012, 7(8):e43163.

[8] Dam P, Kataeva I, Yang SJ, Zhou F, Yin Y, Chou W, Poole FL, Westpheling J, Hettich R, Giannone R: Insights into plant biomass conversion from the genome of the anaerobic thermophilic bacterium Caldicellulosiruptor bescii DSM 6725. Nucleic acids research 2011, 39(8):3240-3254.

[9] Zhou F, Xu Y: cBar: a computer program to distinguish plasmid-derived from chromosome-derived sequence fragments in metagenomics data. Bioinformatics 2010, 26(16):2051-2052.

[10] Zhou F, Chen H, Xu Y: GASdb: a large-scale and comparative exploration database of glycosyl hydrolysis systems. BMC microbiology 2010, 10(1):69.

[11] Zhou F, Xu Y: RepPop: a database for repetitive elements in Populus trichocarpa. BMC genomics 2009, 10(1):14.

[12] Chen Y*, Zhou F*, Li G, Xu Y: MUST: A system for identification of miniature inverted-repeat transposable elements and applications to Anabaena variabilis and Haloquadratum walsbyi. Gene 2009, 436(1):1-7.