项目成员

吴仲义(CHUNG-I WU),中科院北京基因组研究所研究员,博士生导师。

Email:wuci(AT)big.ac.cn

学习经历:

1972年-1976年 台湾东海大学 生物学 学士

1977年-1982年 加拿大英属哥伦比亚大学 遗传学 博士

工作经历:

1976年9月-1977年8月 台湾东海大学 助教

1982年6月-1984年12月 美国德克萨斯大学休斯顿健康中心 博士后

1985年1月-1986年7月 美国威斯康辛大学麦迪逊分校 博士后

1986年8月-1990年8月 美国罗彻斯特大学 助理教授

1990年9月-1991年6月 美国罗彻斯特大学 副教授

1991年7月-1998年6月 美国芝加哥大学 副教授

1998年7月-2006年6月 美国芝加哥大学生态与进化系 系主任

1998年7月-2008年5月 美国芝加哥大学 教授

2004年7月-2008年5月 中山大学 长江学者

2008年6月-2014年5月 中国科学院北京基因组研究所 所长

主要研究领域:肿瘤基因组学 遗传与进化基因组学 计算生物学

承担科研项目情况:

1、国家自然科学基金委主任基金 30950006 ""适应性进化的基因组学—通过第二代测序技术检测基因组变异"" 项目资金 2010年1月-2010年12月 已完成 项目负责人

2、中国科学院知识创新工程重大项目课题 KSCX1-YW-22"癌症重大科学问题及防治新策略的研究",课题"癌症基因组和蛋白质组研究"2009年6月-2012年12月 已完成 课题主持人

3、农业部转基因专项 2009ZX08010-017B "基于micro RNA干涉的转基因新技术的开发与应用"2009年6月-2012年12月 已完成 项目负责人

4、国家自然科学基金重点项目 31130069" MicroRNAs的功能进化分析与全基因组表达稳定性的渠化调控" 2012年1月-2016年12月 正在进行 项目负责人

5、千人计划配套经费 中国科学院 2010-2012 已完成 项目负责人

6、中国科学院重点部署项目 KJZD-EW-L06 "肿瘤微进化和第二代肿瘤基因组学" 201年1月-2015年12月 正在进行 项目负责人

7、科技部973课题 2014CB542006 "肿瘤异质性演化机制与个体治疗策略的生物学研究" 2014年1月-2018年12月 正在进行 课题主持人

代表论著:

1. LanJiang, Jing Zhang, Jing-Jing Wang, Lu Wang, Li Zhang, Xiaodan Yang, Xin Ma, Xin Sun, Jun Cai,Xingxu Huang, Miao Yu, Chuan He, Feng Liu, Chung-I Wu, Bo Zhang, Weimin Ci, Jiang Liu (2013) Sperm, but not oocyte, DNA methylome is inherited by zebrafish early embryos. Cell 153(4):773-84

2. Xu J, Zhang R, Shen Y, Liu G, Lu X, Wu CI*. (2013) The evolution of evolvability in microRNA target sites in vertebrates. Genome research. [Epub ahead of print]

3. Zheng C, Miao X, Li Y, Huang Y, Ruan J, Ma X, Wang L, Wu CI, Cai J. (2013)Determination of genomic copy number alteration emphasizing a restriction site-based strategy of genome re-sequencing. Bioinformatics. [Epub ahead of print]

4. Yang Shena, Yang Lva, Lei Huanga, Wensheng Liua, Ming Wena, Tian Tanga, Rui Zhangb, Eric Hungatec, Suhua Shia, and Chung-I Wu*(2011), Testing hypotheses on the rate of molecular evolution in relation to gene expression using microRNAs. Proc Natl Acad Sci U S A, 108(38): p. 15942-7

5. Tao Y, Ruan J, Yeh SH, Lu X, Wang Y, Zhai W, Cai J, Ling S, Gong Q, Chong Z, Qu Z, Li Q, Liu J, Yang J, Zheng C, Zeng C, Wang HY, Zhang J, Wang SH, Hao L,Dong L, Li W, Sun M, Zou W, Yu C, Li C, Liu G, Jiang L, Xu J, Huang H, Li C, Mi S, Zhang B, Chen B, Zhao W, Hu S, Zhuang SM, Shen Y, Shi S, Brown C, White KP, Chen DS, Chen PJ, Wu CI* (2011)Rapid growth of a hepatocellular carcinoma and the driving mutations revealed by a cell-population genetic analysis of whole-genome data. Proc. Natl. Acad. Sci. 108(29):12042-7

6. Shen Y, Lv Y, Huang L, Liu W, Wen M, Tang T, Zhang R, Hungate E, Shi S, Wu CI*(2011). Rate of molecular evolution in relation to expression level – A test using microRNAs in Drosophila. Proc. Natl. Acad. Sci 108(38)15942-15947

7. Tang T, Kumar S, Shen Y, Lu J, Wu ML, Shi S, Li WH, Wu CI*(2010). Adverse interactions between micro-RNAs and target genes from different species. Proc. Natl. Acad. Sci,107, no. 29: 12935-40

8. Shapiro JA, Huang W, Zhang C, Hubisz MJ, Lu J, Turissini DA, Fang S, Wang HY, Hudson RR, Nielsen R, Chen Z, Wu CI*. (2007). Adaptive Genic evolution in the Drosophila genomes. Proc. Natl. Acad. Sci 104:2271-2276

9. Shapiro JA, Huang W, Zhang C, Hubisz MJ, Lu J, Turissini DA, Fang S, Wang HY, Hudson RR, Nielsen R, Chen Z, Wu CI*. (2007). Adaptive genic evolution in the Drosophila genomes. Proc. Natl. Acad. Sci 104: 2271

10. Sun, S, C. Ting, and C.-I Wu* (2004)The normal function of a speciation gene, Odysseus, and its hybrid sterility effect. Science 305: 81-83.

11. He, J et al. (51 authors) (2004). Molecuar evolution of the SARS-conronavirus during the course of SARS-epidemic in China. Science 303: 1666-1669 (C.-I Wu is a communicating author for the data analysis section).

12. Greenberg, A. J., J. R. Moran, J. A. Coyne, and Chung-I Wu* (2003) Ecological adaptation during incipient speciation as revealed by precise gene replacement. Science 302: 1754-1757.

13. Lu, J., W.-H. Li and C.-I Wu*. (2003) Chromosomal speciation and gene flow. Science 302:988c.

14. Fay, J. C., G. J. Wyckoff and C.-I Wu*, (2002) Testing the neutral theory of molecular evolution with genomic data. Nature 415: 1024 - 1026.

15. Ting, C.-T., S.-C. Tsaur, M.-L. Wu and C.-I Wu*, (1998) A rapidly evolving homeobox at the site of a hybrid sterility gene. Science 282: 1501-1504.

16. Wu, C.-I, H. Hollocher, D. Begun, C. F. Aquadro, Y. Xu and M.-L. Wu. (1995) Sexual isolation in Drosophila melanogaster: A possible case of incipient speciation. Proc. Natl. Acad. Sci. 92:2519-2523.

17. Johnson, N. A., D. E. Perez, E. L. Cabot, H. Hollocher and C.-I Wu. (1992). A test of reciprocal X-Y interactions as a cause of hybrid sterility in Drosophila. Nature 358:751-753.

18. Wu, C.-I, J. R. True and N. Johnson. (1989). Fitness reduction associated with the deletion of a satellite DNA array. Nature. 341:248-251.

19. Wu, C.-I, T. W. Lyttle, M.-L. Wu and G. Lin. (1988). Association between a satellite DNA sequence and the Responder of Segregation Distorter in D. melanogaster. Cell 54:179-189.

20. Wu, C.-I and N. Maeda (1987). Inequality in mutation rates of the two strands of DNA. Nature 327:169-170.

社会任职:

美国科学促进会委员,美国遗传学学术委员会、进化生物学学术委员会常委,中山大学长江学者。曾任和现任PNAS、Molecular Phylogeny and Evolution、Genetics、Genome Biology and Evolution、Gene and Genetic system等期刊副主编。

获奖及荣誉:

1990-1995年获得NIH研究职业发展奖

1989-1991获得全国唐氏综合症协会奖

2004年获得台湾东海大学优秀毕业生奖

2004年被评为中研院院士

2004年美国自然科学进步协会会员