项目成员

赵文明,高级工程师,中科院北京基因组研究所所级中心信息管理部主管。

Email:zhaowm(AT)big.ac.cn

2001年获得西安工业大学学士学位。

2008年获得北京航空航天大学工程硕士学位。

2001至2004年,在北京华大基因研究中心从事生物信息工作。

2004至2008年,在软脑软件(北京)有限公司从事软件开发工作。

2008年至今,在中国科学院北京基因组研究所从事基因组及生物信息学研究工作工作。

在工作期间,先后主持和参与中科院信息化工作的相关科研项目、自然科学基金的面上项目及国际重大合作项目等多个项目,申请计算机软件著作权2项。

主要研究领域:高通量测序平台下的海量基因组数据处理方法、数据挖掘、展示及管理方法。

代表论著:

(1)Zhao W, Liu W, Tian D, Tang B, Wang Y, Yu C, Li R, Ling Y, Wu J, Song S, Hu S. 2011. wapRNA: a web-based application for the processing of RNA sequences. Bioinformatics. 27:3076-7.

(2)Tao Y, Ruan J, Yeh SH, Lu X, Wang Y, Zhai W, Cai J, Ling S, Gong Q, Zhao W, et al. 2011. Rapid growth of a hepatocellular carcinoma and the driving mutations revealed by cell-population genetic analysis of whole-genome data. Proc Natl Acad Sci U S A. 108:12042-7.

(3)Zhou R*, Ling S*, Zhao W*, Osada N, Chen S, Zhang M, He Z, et al. 2011. Population genetics in nonmodel organisms: II. natural selection in marginal habitats revealed by deep sequencing on dual platforms. Mol Biol Evol. 28:2833-42.

(4)Yu J, Wang J, Lin W, Li S, Li H, Zhou J, Ni P, Dong W, Hu S, Zhao W, et al. 2005. The Genomes of Oryza sativa: a history of duplications. PLoS Biol. 3:e38.

(5)Wong GK, Liu B, Wang J, Zhang Y, Yang X, Zhang Z, Meng Q, Zhao W, et al. 2004. A genetic variation map for chicken with 2.8 million single-nucleotide polymorphisms. Nature. 432:717-22.

(6)Zhao W, Wang J, He X, Huang X, et al. 2004. BGI-RIS: an integrated information resource and comparative analysis workbench for rice genomics. Nucleic Acids Res. 32:D377-82.

(7)Yu J, Hu S, Wang J, Wong GK, Li S, Liu B, Deng Y, Dai L, Zhao W, et al. 2002. A draft sequence of the rice genome (Oryza sativa L. ssp. indica). Science. 296:79-92.